0 Povzetek košarice

Vpiši iskalni niz

Projekt J3-2532

Bradikininski angioedem: novi biološki označevalci in genetska predizpozicija

Raziskovalni projekt ARRS.
Evidenčna številka: J3-2532
Obdobje 1.9.2020 - 31.8.2023
Vodja: Doc. dr. Matija Rijavec, univ. dipl. mikr.
Raziskovalna dejavnost: Medicina/Reprodukcija človeka
Letni obseg: 0,23 FTE v 2020

Seznam sodelujočih raziskovalnih organizacij:  Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik Univerza v Ljubljani, Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta

Sestava projekte skupine.


Vsebinski opis projekta

Angioedem (AE) je stanje, za katerega je značilen nenaden pojav lokalizirane otekline podkožja ali sluznic. Nastane kot posledica vazodilatacije in povečane permeabilnosti žil. Klinična slika zajema otekanje obraza, vek, ustnic, grla, jezika, spolovil in gastrointestinalnega trakta. AE se pogosto pojavlja skupaj z urtikarijo oz. koprivnico. Če se ponavljajoč AE razvije brez izrazite urtikarije, ima tak bolnik izolirani/primarni AE. Po ocenah, naj bi bila prevalenca, da bo posameznik doživel vsaj en izolirani AE v življenju celo do 10 %.

V veliki meri (okrog 70 %) je bolezen posredovana z mediatorji mastocitov, kot je histamin (histaminergični AE, H-AE). Za zdravljenje se uporabljajo antihistaminiki in kortikosteroidi. V pomembnem deležu (okrog 30 %) pa je bolezen posredovana preko bradikinina (bradikininski angioedem, Bk-AE), na kar se osredotoča omenjeni projekt. Bk vpliva na vazodilatacijo in povečano propustnost kapilar. Motnje v uravnavanju metabolizma Bk vodijo do različnih vrst pridobljenih in dednih (hereditarnih) ponavljajočih se AE, ki se ne odzivajo na antihistaminike in kortikosteroide. Za zdravljenje se uporabljajo terapije, ki vplivajo na pot Bk.

Kar 50 % bolnikov z AE ima napačno postavljeno diagnozo. Največjo oviro predstavlja ravno razlikovanje med alergijskim (H-AE) in ne-alergijskim AE (Bk-AE). Pogosto poteče veliko časa od pojava simptomov do postavitve pravilne diagnoze. Če bolniki z AE niso zdravljeni, oziroma niso zdravljeni pravilno, so lahko otekanja pogosta, kar zelo poslabša kvaliteto življenja. Bolniki, so zaradi simptomov omejeni več tednov na leto, kar predstavlja tudi velik ekonomski problem. Najbolj zaskrbljujoč je AE grla, saj lahko napačno zdravljenje vodi do smrti zaradi zadušitve. Ker različne vrste AE, do katerih pride zaradi različnih vzrokov, zahtevajo drugačno zdravljenje, je postavitev pravilne diagnoze ključnega pomena za preprečitev nadaljnjega trpljenja teh bolnikov. Razlikovanje med Bk-AE od H-AE, ostaja najpomembnejši in zelo pogost problem, s katerim se zdravniki soočajo, med klinično obravnavo AE, saj je razlikovanje zelo omejeno zaradi pomanjkanja diagnostičnih testov. Diagnoza je zato pogosto postavljena z izključitvijo drugih, alternativnih diagnozkar je, kot že omenjeno, povezano z napačno in zapoznelo postavitvijo diagnoze.

Projekt nam bo omogočil določiti klinično uporabne biološke označevalce za razlikovanje med Bk-AE in H-AE. Tako bomo lahko izbrali bolnike, katerim bo koristilo zdravljenje s tarčno terapijo, ki vpliva na pot Bk. Velik del projekta bo usmerjen k identifikaciji genetske predispozicije in dejavnikov, ki vplivajo na različno izražanje bolezni pri Bk-AE, kar nam bo pomagalo pri boljšem razumevanju osnovnih mehanizmov. S tem nam bo omogočeno boljše razumevanje in spremljanje bolnikov z AE.

V projektu bomo izvedli več med seboj povezanih aktivnosti, ki bodo razdeljene na različne konceptualno podobne dele (delovne pakete, WP). Zajemali bodo vključitev bolnikov in celovito klinično opredelitev, kateri bo sledilo odkrivanje in validacija klinično uporabnih bioloških označevalcev za razlikovanje med Bk-AE in H-AE (WP1 in WP2). To nam bo omogočilo izbrati bolnike, katerih tarčno zdravljenje vpliva na pot Bk. Velik del projekta bo usmerjen k identifikaciji genetskih dejavnikov oz. genetske predispozicije za Bk-AE (WP3 in WP4) ter dejavnikov, ki vplivajo na različno izražanje bolezni (WP5), z uporabo različnih dopolnjujočih se strategij in metod. Temu bo sledila tudi osnovna funkcionalna karakterizacija (WP6) novo identificiranih različic (v znanih s HAE povezanih genih in v novo odkritih genih). Končni cilj projekta je identifikacija biokemijskih označevalcev in genetske predispozicije, vključno z genetskimi dejavniki, ki vplivajo na izražanje Bk-AE, kar nam bo pomagalo pri boljšem razumevanju osnovnih mehanizmov bolezni. S tem pa nam bo omogočeno boljše spremljanje bolnikov z AE.


Časovnica projekta

 

Leto 1

Leto 2

Leto 3

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

WP1

T1.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T1.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

WP2

T2.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T2.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T2.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

WP3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T3.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T3.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

WP4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T4.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T4.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T4.3

 

 

 

 

 

WP5

T5.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T5.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T5.3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T5.4

 

 

 

 

 

WP6

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T6.1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T6.2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T6.2

 

 

 

 

 

 


Faze projekta in njihova realizacija

Delovni paket (WP)

Naloge (T)

Mejniki in Rezultati

Razpored dela

WP1

Določitev klinično uporabnih biokemijskih označevalcev

T1.1

Vključitev dobro opredeljenih bolnikov z

Bk-AE & H-AE

Vzorci približno 100 bolnikov,

klinični in laboratorijski podatki

Klinika Golnik

T1.2

Določitev stimulirane kalikreinske aktivnosti in cHMWK

Ovrednotenje klinične uporabnosti biokemičnih označevalcev

Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, UL,

Klinika Golnik

WP2

Validacija biokemijskih označevalcev)

T2.1

Vključitev nove skupine dobro opredeljenih bolnikov z AE

Vzorci približno 300 bolnikov,

klinični in laboratorijski podatki

Klinika Golnik

T2.2

Določitev biokemijskih označevalcev

Ovrednotenje klinične uporabnosti biokemičnih označevalcev na veliki skupini bolnikov

Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, UL,

Klinika Golnik

WP3

Določitev genetskih dejavnikov v znanih genih povezanih s HAE

T3.1

WES na vzorcih bolnikov z Bk-AE

Izvedba WES pri izbranih bolnikih

z Bk-AE (iz WP1 & WP2)

Klinika Golnik

T3.2

Analiza WES za znane gene povezane s HAE

Rezultati WES

Določitev vzročnih različic v znanih genih povezanih s HAE

(SERPING1, F12, PLG, ANGPT1, KNG1)

Klinika Golnik

WP4

Iskanje novih genetskih dejavnikov odgovornih za HAE

T4.1

Vključitev bolnikov

Vzorci DNA, klinični in laboratorijski podatki, izbrane družine

Klinika Golnik

T4.2

WES pri bolnikih z U-HAE

Rezultati WES

Odkritje novih genetskih dejavnikov odgovornih za U-HAE

Klinika Golnik

T4.3

Ponovna analiza WES (iz WP3)

Rezultati ponovne analize WES

Potrditev novih vzročnih različic pri ostalih bolnikih z Bk-AE

Klinika Golnik

WP5

Identifikacija genetskih dejavnikov, ki vplivajo na različno izražanje bolezni

T5.1

Vključitev bolnikov

Vzorci biobanke DNA bolnikov s C1-INH-HAE (različna teža bolezni, asimptomatski)

Klinika Golnik

T5.2

WES pri izbranih bolnikih z C1-INH-HAE

Rezultati WES

Odkritje genetskih dejavnikov (različic/genov), ki vplivajo na težo in penetranco bolezni pri

bolnikih s C1-INH-HAE

Klinika Golnik

T5.3

Genotipizacija izbranih različic za celotni skupini bolnikov z C1-INH-HAE

Potrditev relevantnosti različic/genov, ), ki vplivajo na težo in penetranco bolezni na večji skupini bolnikov s (>150 bolnikov)

Klinika Golnik

T5.4

Ponovna analiza WES (iz WP3)

Rezultati ponovne analize WES

Potrditev genetskih dejavnikov (različic/genov), ki vplivajo na težo pri ostalih bolnikih z Bk-AE

Klinika Golnik

WP6

Biološka in funkcionalna analiza

T6.1

Bioinformatika

In silico napoved funkcionalnosti identificiranih variant/genov

Klinika Golnik,

Medicinska fakulteta, UL

T6.2

Funkcionalna analiza

Funkcionalna analiza različic (metoda odvisna od predvidenega vpliva različice na protein)

Klinika Golnik,

Medicinska fakulteta, UL